Mae yna lawer o fathau o peptidau trawsbilen, ac mae eu dosbarthiad yn seiliedig ar briodweddau ffisegol a chemegol, ffynonellau, mecanweithiau llyncu, a chymwysiadau biofeddygol.Yn ôl eu priodweddau ffisegol a chemegol, gellir rhannu peptidau treiddiol bilen yn dri math: cationig, amffiffilig a hydroffobig.Mae peptidau treiddgar pilen cationig ac amffiffilig yn cyfrif am 85%, tra bod peptidau treiddio pilen hydroffobig yn cyfrif am ddim ond 15%.
1. peptid treiddiol bilen cationig
Mae peptidau trawsbilen cationig yn cynnwys peptidau byr sy'n llawn arginin, lysin, a histidine, fel TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 a DPV6.Yn eu plith, mae arginine yn cynnwys guanidine, a all bondio hydrogen â grwpiau asid ffosfforig â gwefr negyddol ar y gellbilen a chyfryngu peptidau trawsbilen i'r bilen o dan gyflwr gwerth PH ffisiolegol.Dangosodd astudiaethau o oligarginine (o 3 R i 12 R) mai dim ond pan oedd maint yr arginin mor isel ag 8 y cyflawnwyd gallu treiddiad y bilen, a chynyddodd gallu treiddiad y bilen yn raddol gyda chynnydd yn swm yr arginin.Nid yw lysin, er ei fod yn cationig fel arginine, yn cynnwys guanidine, felly pan fydd yn bodoli ar ei ben ei hun, nid yw ei effeithlonrwydd treiddiad pilen yn uchel iawn.Mae Futaki et al.(2001) mai dim ond pan oedd y peptid treiddio cellbilen cationig yn cynnwys o leiaf 8 asid amino â gwefr bositif y gellid cyflawni effaith treiddiad pilen dda.Er bod gweddillion asid amino â gwefr bositif yn hanfodol er mwyn i beptidau treiddiol dreiddio i'r bilen, mae asidau amino eraill yr un mor bwysig, megis pan fydd W14 yn treiglo i F, mae treiddiad Penetratin yn cael ei golli.
Dosbarth arbennig o beptidau trawsbilen cationig yw dilyniannau lleoleiddio niwclear (NLSs), sy'n cynnwys peptidau byr sy'n llawn arginin, lysin a phroline a gellir eu cludo i'r cnewyllyn trwy'r cyfadeilad mandwll niwclear.Gellir rhannu NLSs ymhellach yn deipio sengl a dwbl, sy'n cynnwys un a dau glwstwr o asidau amino sylfaenol, yn y drefn honno.Er enghraifft, mae PKKKRKV o firws simian 40 (SV40) yn NLS teipio sengl, tra bod protein niwclear yn NLS teipio dwbl.KRPAATKKAGQAKKKL yw'r dilyniant byr a all chwarae rhan mewn trawsbilen pilen.Oherwydd bod gan y mwyafrif o NLSs niferoedd gwefr sy'n llai nag 8, nid yw NLSs yn peptidau trawsbilen effeithiol, ond gallant fod yn beptidau trawsbilen effeithiol pan fyddant wedi'u cysylltu'n cofalent â dilyniannau peptid hydroffobig i ffurfio peptidau trawsbilen amffiffilig.
2. Peptid trawsbilen amphiphilic
Mae peptidau trawsbilen amffiffilig yn cynnwys parthau hydroffilig a hydroffobig, y gellir eu rhannu'n amffiffilig cynradd, amffiffilig α-helical eilaidd, amffiffilig β-blygu ac amffiffilig wedi'i gyfoethogi â phrolin.
Peptidau bilen gwisgo amffiffilig math cynradd yn ddau gategori, categori gyda NLSs wedi'u cysylltu'n cofalent gan ddilyniant peptid hydroffobig, megis MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) a Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), Mae'r ddau yn seiliedig ar y signal lleoleiddio niwclear PKKKRKV o SV40, Mae parth MPG yn gysylltiedig â dilyniant ymasiad HIV glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), ac mae parth hydroffobig Pep-1 yn gysylltiedig â'r clwstwr cyfoethog tryptoffan sydd ag affinedd pilen uchel (KETWWET WWTEW).Fodd bynnag, mae parthau hydroffobig y ddau yn gysylltiedig â signal lleoleiddio niwclear PKKKRKV trwy WSQP.Roedd dosbarth arall o beptidau trawsbilen amffiffilig cynradd wedi'u hynysu o broteinau naturiol, megis pVEC, ARF(1-22) a BPrPr(1-28).
Mae'r peptidau trawsbilen amffiffilig α-helical uwchradd yn rhwymo i'r bilen trwy α-helices, ac mae eu gweddillion asid amino hydroffilig a hydroffobig wedi'u lleoli ar wahanol arwynebau'r strwythur helical, megis MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).Ar gyfer bilen gwisgo amffiffilig math plygu beta peptid, mae ei allu i ffurfio taflen beta pleated yn hanfodol i allu treiddiad y bilen, megis yn VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) yn y broses o ymchwilio i allu treiddiad y bilen, gan ddefnyddio'r math D - ni allai analogau treiglad asid amino ffurfio darn plygu beta, mae gallu treiddiad y bilen yn wael iawn.Mewn peptidau trawsbilen amffiffilig wedi'u cyfoethogi â phrolin, mae polyproline II (PPII) yn cael ei ffurfio'n hawdd mewn dŵr pur pan fydd proline wedi'i gyfoethogi'n fawr yn y strwythur polypeptid.Helics llaw chwith yw PPII gyda 3.0 o weddillion asid amino y tro, yn hytrach na'r strwythur alffa-helix safonol ar y dde gyda 3.6 o weddillion asid amino fesul tro.Roedd peptidau trawsbilen amffiffilig wedi'u cyfoethogi â phroline yn cynnwys peptid gwrthficrobaidd buchol 7 (Bac7), polypeptid synthetig (PPR) n (n gallu bod yn 3, 4, 5 a 6), ac ati.
3. peptid treiddio pilen hydroffobig
Mae peptidau trawsbilen hydroffobig yn cynnwys dim ond gweddillion asid amino an-begynol, gyda thâl net o lai nag 20% o gyfanswm tâl y dilyniant asid amino, neu'n cynnwys moieties hydroffobig neu grwpiau cemegol sy'n hanfodol ar gyfer trawsbilen.Er bod y peptidau trawsbilen cellog hyn yn aml yn cael eu hanwybyddu, maent yn bodoli, fel ffactor twf ffibroblast (K-FGF) a ffactor twf ffibroblast 12 (F-GF12) o sarcoma Kaposi.
Amser post: Maw-19-2023