Ar yr wyneb, mae ffurfio bondiau peptid, sy'n cynhyrchu dipeptidau, yn broses gemegol syml.Mae hyn yn golygu bod y ddwy gydran asid amino yn cael eu cysylltu gan fond peptid, sef bond amid, tra'n cael eu dadhydradu.
Ffurfio bond peptid yw actifadu asid amino o dan amodau adwaith ysgafn.(A) moiety carbocsyl, ail asid amino (B) Mae'r moiety carbocsyl actifedig niwcleoffilig wedyn yn ffurfio'r deupeptid (AB).“Os nad yw'r gydran carboxyl (A) wedi'i diogelu, ni ellir rheoli ffurfio'r bond peptid.”Gellir cymysgu sgil-gynhyrchion megis peptidau llinol a chylchol â chyfansoddion targed AB.Felly, rhaid amddiffyn pob grŵp swyddogaethol nad yw'n ymwneud â ffurfio bond peptid mewn modd cildroadwy dros dro yn ystod synthesis peptidau.
Felly, mae synthesis peptid - ffurfio pob bond peptid - yn cynnwys tri cham agregu.
Y cam cyntaf yw paratoi rhai asidau amino sydd angen eu hamddiffyn, ac nid yw strwythur zwitterionic asidau amino yn bodoli mwyach.
Mae'r ail gam yn adwaith dau gam i ffurfio bondiau peptid, lle mae'r grŵp carboxyl o'r asid amino gwarchodedig N yn cael ei actifadu yn gyntaf i'r canolradd gweithredol ac yna mae'r bond peptid yn cael ei ffurfio.Gall yr adwaith cypledig hwn ddigwydd naill ai fel adwaith un cam neu fel dau adwaith dilyniannol.
Y trydydd cam yw tynnu'n ddetholus neu ddileu'r sylfaen amddiffynnol yn llwyr.Er mai dim ond ar ôl i'r holl gadwyni peptid gael eu cydosod y gall yr holl dynnu ddigwydd, mae angen tynnu grwpiau amddiffynnol yn ddetholus hefyd er mwyn parhau â synthesis peptid.
Oherwydd bod 10 asid amino (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec a Cys) yn cynnwys grwpiau swyddogaethol cadwyn ochr, sydd angen amddiffyniad dethol, gan wneud synthesis peptid yn fwy cymhleth.Rhaid gwahaniaethu rhwng seiliau amddiffyn dros dro a lled-barhaol oherwydd y gwahanol ofynion ar gyfer detholusrwydd.Defnyddir grwpiau amddiffyn dros dro yn y cam nesaf i adlewyrchu amddiffyniad dros dro grwpiau swyddogaethol asid amino neu garboxyl.Mae grwpiau amddiffynnol lled-barhaol yn cael eu tynnu heb ymyrryd â bondiau peptid a ffurfiwyd eisoes neu gadwyni ochr asid amino, weithiau yn ystod synthesis.
“Yn ddelfrydol, dylai gweithrediad y gydran carboxyl a ffurfio bondiau peptid yn dilyn hynny (adweithiau cyplu) fod yn gyflym, heb ffurfio hilmig neu sgil-gynnyrch, a dylid defnyddio adweithyddion molar i sicrhau cynnyrch uchel.”Yn anffodus, nid yw'r un o'r dulliau cyplu cemegol yn bodloni'r gofynion hyn, ac ychydig sy'n addas ar gyfer synthesis ymarferol.
Yn ystod synthesis peptid, mae'r grwpiau swyddogaethol sy'n ymwneud ag adweithiau amrywiol fel arfer yn gysylltiedig â'r ganolfan â llaw, glycin yw'r unig eithriad, ac mae risg bosibl o gylchdroi.
Y cam olaf yn y cylch synthesis peptid yw dileu pob grŵp amddiffynnol.Mae tynnu grwpiau amddiffynnol yn ddetholus yn bwysig ar gyfer estyniad cadwyn peptid yn ogystal â'r gofyniad i gael gwared yn llwyr ar amddiffyniad mewn synthesis deupeptid.Dylid cynllunio strategaethau synthetig yn ofalus.Yn dibynnu ar y dewis strategol, gall N gael gwared ar y grwpiau diogelu α-amino neu garboxyl yn ddetholus.Mae'r term “strategaeth” yn cyfeirio at ddilyniant adweithiau cyddwyso asidau amino unigol.Yn gyffredinol, mae gwahaniaeth rhwng synthesis graddol ac anwedd darn.Mae synthesis peptid (a elwir hefyd yn “synthesis confensiynol”) yn digwydd mewn hydoddiant.Yn y rhan fwyaf o achosion, dim ond trwy ddefnyddio'r gadwyn peptid i syntheseiddio darnau byrrach y gellir syntheseiddio ymestyn y gadwyn peptid yn raddol.Er mwyn syntheseiddio peptidau hirach, rhaid i'r moleciwlau targed gael eu rhannu'n ddarnau priodol a phenderfynu y gallant leihau graddau'r gwahaniaethu ar derfynfa C.Ar ôl i'r darnau unigol gael eu cydosod yn raddol, bydd y cyfansawdd targed yn cael ei gydgysylltu.Mae strategaeth synthesis peptid yn cynnwys dewis y darn amddiffynnol gorau a mwyaf priodol, ac mae'r strategaeth o synthesis peptid yn cynnwys dewis y cyfuniad mwyaf priodol o seiliau amddiffynnol a'r dull gorau o gyfuno darnau.
Amser postio: Gorff-19-2023