Cynllun dylunio a datrysiad cadwyn peptid polypeptid

I. Crynodeb
Mae peptidau yn macromoleciwlau arbennig fel bod eu dilyniannau yn anarferol yn eu nodweddion cemegol a ffisegol.Mae rhai peptidau yn anodd eu syntheseiddio, tra bod eraill yn gymharol hawdd i'w syntheseiddio ond yn anodd eu puro.Y broblem ymarferol yw bod y rhan fwyaf o peptidau ychydig yn hydawdd mewn datrysiadau dyfrllyd, felly yn ein puro, rhaid diddymu'r rhan gyfatebol o'r peptid hydroffobig mewn toddyddion nad ydynt yn ddyfrllyd, Felly, mae'r toddyddion neu'r byfferau hyn yn debygol o fod yn anghyson iawn â'r defnydd. o weithdrefnau arbrofol biolegol, fel bod technegwyr yn cael eu gwahardd yn llym rhag defnyddio'r peptid at eu dibenion eu hunain, fel bod y canlynol yn sawl agwedd ar ddylunio peptidau ar gyfer ymchwilwyr.

Cynllun dylunio a datrysiad cadwyn peptid polypeptid
Yn ail, y dewis cywir o peptidau anodd synthetig
1. Cyfanswm hyd y dilyniannau wedi'u rheoleiddio i lawr
Mae'n haws cael peptidau o lai na 15 o weddillion oherwydd bod maint y peptid yn cynyddu ac mae purdeb y cynnyrch crai yn lleihau.Wrth i gyfanswm hyd y gadwyn peptid gynyddu y tu hwnt i 20 o weddillion, mae union faint y cynnyrch yn bryder allweddol.Mewn llawer o arbrofion, mae'n hawdd cael effeithiau annisgwyl trwy ostwng nifer y gweddillion o dan 20.
2. Lleihau nifer y gweddillion hydroffobig
Mae peptidau â goruchafiaeth fawr o weddillion hydroffobig, yn enwedig yn y rhanbarth 7-12 gweddillion o'r C-terminus, fel arfer yn achosi anawsterau synthetig.Mae hyn yn cael ei weld fel cyfuniad annigonol yn union oherwydd bod taflen B-plyg yn cael ei sicrhau yn y synthesis.“Mewn achosion o’r fath, gall fod yn ddefnyddiol trosi mwy na dau weddillion positif a negyddol, neu roi Gly neu Pro yn y peptid i ddatgloi cyfansoddiad y peptid.”
3. Is-reoleiddio gweddillion “anodd”.
“Mae yna nifer o weddillion Cys, Met, Arg, a Try nad ydynt yn gyffredinol yn hawdd eu syntheseiddio.”Bydd ser fel arfer yn cael ei ddefnyddio fel dewis arall anocsidiol i Cys.
Cynllun dylunio a datrysiad cadwyn peptid polypeptid

Yn drydydd, gwella'r dewis cywir o hydawdd mewn dŵr
1. Addaswch derfynfa N neu C
O'i gymharu â pheptidau asidig (hynny yw, wedi'i wefru'n negyddol ar pH 7), mae asetyleiddiad (asetyliad N-terminus, terfynfa C bob amser yn cynnal grŵp carboxyl am ddim) yn cael ei argymell yn arbennig i gynyddu'r tâl negyddol.Fodd bynnag, ar gyfer peptidau sylfaenol (hynny yw, â gwefr bositif ar pH 7), argymhellir yn arbennig amination (grŵp amino rhad ac am ddim yn y N-terminus a amination yn y C-terminus) i gynyddu'r tâl positif.

2. Byrhau neu ymestyn y dilyniant yn fawr

Mae rhai o'r dilyniannau yn cynnwys nifer fawr o asidau amino hydroffobig, megis Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ac Ala, ac ati Pan fydd y gweddillion hydroffobig hyn yn fwy na 50%, fel arfer nid ydynt yn hawdd eu diddymu.Gall fod yn ddefnyddiol ymestyn y dilyniant i gynyddu polion positif a negyddol y peptid ymhellach.Yr ail opsiwn yw is-reoleiddio maint y gadwyn peptid i gynyddu'r polion positif a negyddol trwy is-reoleiddio'r gweddillion hydroffobig.Po gryfaf yw ochrau positif a negyddol y gadwyn peptid, y mwyaf tebygol yw hi o adweithio â dŵr.
3. Rhowch weddillion sy'n hydoddi mewn dŵr i mewn
Ar gyfer rhai cadwyni peptid, gall y cyfuniad o rai asidau amino positif a negyddol wella hydoddedd dŵr.Mae ein cwmni'n argymell cyfuno N-terminus neu C-terminus peptidau asidig â Glu-Glu.Rhoddwyd terminws N neu C y peptid sylfaenol ac yna Lys-Lys.Os na ellir gosod y grŵp y codir tâl amdano, gellir gosod Ser-Gly-Ser hefyd yn y terminws N neu C.Fodd bynnag, nid yw'r dull hwn yn gweithio pan na ellir newid ochrau'r gadwyn peptid.